流动性是衡量市场运行质量的重要维度之一，其定义是资产能够以一个合理的价格顺利变现的能力。买卖价差是流动性的常用维度之一，具体分为报价买卖价差、百分比报价买卖价差和有效买卖价差。而有效买卖价差衡量了交易的冲击成本，等于一定时间内所有交易的平均有效半价差，有效半价差等于单笔交易的成交价格减去前报价中点的绝对值。
交易延迟的衡量有两个测度，第一个测度是最小延迟。从发出限价指令单到第一次撤回指令（可以部分撤回）是限价指令单的生存周期，一定时间内限价指令单的最短生存周期是最小延迟。生存周期的均值也具有一定的参考价值，称为限价指令单久期。第二种是策略性行程测度衡量。市场深度定义为推动价格变动达到1%所需要的平均交易量。
做市商被动成交占比是衡量做市商做市行为的指标，也是市场深度的衡量指标之一。当做市活动较为频繁时，被动成交占比较高。当某限价指令单被其他参与者主动成交时，该限价指令单为被动成交，对应的测度有被动成交额、被动成交量等。这些测度经过全市场成交的标准化以后可以在一定程度上反映市场的流动性。
参与做市活动是高频交易商的重要策略之一。衡量做市活动参与情况的一个测度为做市活动参与率。最优买价和卖价报单称为内部报价。构建做市活动参与率的过程如下：首先每个交易日内对10秒的区间进行采样，然后计算采样中出现内部报价的比例。另外，交易量也可以作为流动性的衡量指标之一。
价格发现是资本市场的基本功能之一，衡量了资产价格反映新信息的速度。价格发现的检验较为复杂，早期的未成交订单余额检验和价格延误检验是检验市场价格发现功能的有效方法。
波动性是市场运行质量的另一个维度，也是监管层重点关注的维度。常见的波动性测度是波动率，即一定时间范围内资产收益的标准差。波动性的另一个测量维度是一定时间范围内报价中点的最高价减去最低价。
除了流动性、价格发现和波动性以外，部分学者也研究了市场质量的其他维度，比如逆向选择成本。由于高频交易商在交易中具有的信息优势和交易速度优势，其他交易者会被高频交易商逆向选择。高频交易商作为典型的知情交易者，逆向选择成本是高频交易商对其他市场参与者施加的交易成本。
