高频交易与通过交易员进行交易存在本质不同。高频交易通过及时的数据获取与分析，构建符合理论模型预测的投资策略，最终交由自动化程序软件不折不扣地加以执行。与之相比，作为人的交易员即使能力再超群，经验再丰富，其判断也会出错且难免会受到主观偏好的影响。

例如，交易员通常倾向于偏好一些简洁或吉利的数字并本能地避开不规则或不吉利的数字——他们会以1、6、8手的数量下单，会以8.08元、6.08的价格下单，会选择每隔一秒或一分钟下单，而这些偏好则会给竞争对手（尤其是擅长数据分析的高频交易程序）留下线索并被其充分利用[10]。相比而言，高频交易并非依赖于人的主观判断，也不受人的情感或偏好所左右，因此高频交易完全避免了人的非理性行为影响，从而实现理性化投资。